تعود أهمية وجود صبغة الكاروتين في الطحالب التي تعيش تحت سطح الماء بدلاً من صبغة الكلوروفيل إلى

تعود أهمية وجود صبغة الكاروتين في الطحالب التي تعيش تحت سطح الماء إلى قدرتها على امتصاص أطوال موجية من الضوء لا تستطيع صبغة الكلوروفيل امتصاصها بكفاءة، مثل الضوء الأزرق والأخضر الذي يخترق المياه بشكل أفضل، وتساعد هذه الصبغة الطحالب على إتمام عملية البناء الضوئي بفعالية أكبر في بيئات مائية عميقة أو مظللة، حيث تقل شدة الضوء الأحمر والأصفر الذي يمتصه الكلوروفيل بشكل رئيسي، بالإضافة إلى ذلك، تعمل الكاروتينات كمضادات أكسدة، تحمي الطحالب من الأضرار الناتجة عن الأشعة فوق البنفسجية والإجهاد التأكسدي.